中学校は3つあり、それぞれ次のような地区の小学校から進学するようになっています。
下妻中学校 ・・・ 下妻小学校・上妻小学校・総上小学校
下妻東部中学校 ・・・ 大宝小学校・騰波ノ江小学校・高道祖小学校・豊加美小学校
千代川中学校 ・・・ 蚕飼小学校・宗道小学校・大形小学校
高等学校も2つあります。
下妻第一高等学校・・・ 茨城県内で水戸・土浦に続き3番目に設置された歴史のある学校。もと男子高校で現在共学。
下妻第二高等学校・・・ もと女子高校で現在共学。 野球で甲子園に出場しました。
その他 下妻養護学校